Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis implementasi pendidikan karakter melalui integrasi sains dan agama di sekolah berbasis kesehatan, khususnya di SMK Citra Bangsa Mandiri Purwokerto pada jurusan Farmasi dan Asisten Keperawatan. Pendekatan penelitian ini menggunakan metode kualitatif dengan teknik observasi, wawancara mendalam, dan dokumentasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa proses integrasi sains dan agama dilakukan dalam bentuk pembelajaran teori dan praktik yang menggabungkan ilmu kesehatan dengan nilai-nilai spiritual Islami, seperti kejujuran, empati, tanggung jawab, dan amanah. Contohnya terlihat dalam praktik perawatan pasien dan jenazah, di mana siswa tidak hanya belajar teknis keperawatan, tetapi juga adab dan do’a sesuai ajaran Islam. Faktor pendukung implementasi integrasi meliputi peran aktif guru, kurikulum kejuruan yang fleksibel, serta budaya sekolah yang religius. Sementara itu, hambatannya meliputi keterbatasan waktu pengintegrasian di semua mata pelajaran serta kurangnya pelatihan guru dalam integrasi lintas disiplin. Penelitian ini merekomendasikan penguatan pelatihan guru serta penyesuaian kurikulum berbasis integratif untuk menciptakan lulusan yang profesional sekaligus berkarakter islami.